Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ3A6PVS8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ3A6PVS8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.7 ms