Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pm20d2A3KG59 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms