Protein–RNA interactions for Protein: A2ADA5

Pusl1, tRNA pseudouridine synthase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pusl1A2ADA5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pusl1A2ADA5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pusl1A2ADA5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pusl1A2ADA5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms