Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdc27A2A6Q5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdc27A2A6Q5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdc27A2A6Q5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdc27A2A6Q5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdc27A2A6Q5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdc27A2A6Q5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc27A2A6Q5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms