Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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