Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms