Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms