Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt6Q9R0N8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt6Q9R0N8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms