Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dpf1Q9QX66 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dpf1Q9QX66 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Dpf1Q9QX66 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dpf1Q9QX66 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dpf1Q9QX66 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dpf1Q9QX66 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dpf1Q9QX66 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dpf1Q9QX66 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dpf1Q9QX66 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dpf1Q9QX66 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms