Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms