Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms