Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpa33Q9JKA5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms