Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cldn19Q9ET38 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Cldn19Q9ET38 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Cldn19Q9ET38 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Cldn19Q9ET38 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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Cldn19Q9ET38 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Cldn19Q9ET38 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn19Q9ET38 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms