Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms