Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms