Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Xab2Q9DCD2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms