Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slx4ipQ9D7Y9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slx4ipQ9D7Y9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slx4ipQ9D7Y9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slx4ipQ9D7Y9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slx4ipQ9D7Y9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slx4ipQ9D7Y9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slx4ipQ9D7Y9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slx4ipQ9D7Y9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slx4ipQ9D7Y9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4ipQ9D7Y9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms