Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc3Q9D6Y1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc3Q9D6Y1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms