Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pfn4Q9D6I3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms