Protein–RNA interactions for Protein: Q9D496

4930548H24Rik, RIKEN cDNA 4930548H24, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930548H24RikQ9D496 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930548H24RikQ9D496 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms