Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc17Q9CXD9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc17Q9CXD9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms