Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc96Q9CR92 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms