Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ska1Q9CPV1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms