Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PACSIN1Q9BY11 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms