Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS2Q9BXC9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms