Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms