Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT92

TCHP, Trichoplein keratin filament-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCHPQ9BT92 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCHPQ9BT92 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCHPQ9BT92 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms