Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim11Q99PQ2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim11Q99PQ2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim11Q99PQ2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim11Q99PQ2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim11Q99PQ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim11Q99PQ2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim11Q99PQ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim11Q99PQ2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim11Q99PQ2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim11Q99PQ2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim11Q99PQ2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms