Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms