Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlgn1Q99K10 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms