Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ophn1Q99J31 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ophn1Q99J31 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms