Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms