Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMOQ99835 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMOQ99835 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMOQ99835 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMOQ99835 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMOQ99835 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMOQ99835 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMOQ99835 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMOQ99835 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMOQ99835 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMOQ99835 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMOQ99835 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMOQ99835 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMOQ99835 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMOQ99835 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMOQ99835 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMOQ99835 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMOQ99835 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMOQ99835 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMOQ99835 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMOQ99835 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMOQ99835 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMOQ99835 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMOQ99835 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMOQ99835 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMOQ99835 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMOQ99835 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMOQ99835 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMOQ99835 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMOQ99835 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMOQ99835 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMOQ99835 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMOQ99835 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMOQ99835 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMOQ99835 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMOQ99835 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMOQ99835 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMOQ99835 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMOQ99835 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMOQ99835 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMOQ99835 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMOQ99835 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMOQ99835 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMOQ99835 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMOQ99835 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMOQ99835 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMOQ99835 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMOQ99835 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMOQ99835 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMOQ99835 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMOQ99835 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMOQ99835 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMOQ99835 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMOQ99835 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMOQ99835 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMOQ99835 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMOQ99835 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMOQ99835 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMOQ99835 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMOQ99835 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMOQ99835 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMOQ99835 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMOQ99835 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMOQ99835 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMOQ99835 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMOQ99835 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMOQ99835 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMOQ99835 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMOQ99835 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMOQ99835 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMOQ99835 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMOQ99835 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMOQ99835 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMOQ99835 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMOQ99835 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMOQ99835 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMOQ99835 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMOQ99835 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMOQ99835 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMOQ99835 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMOQ99835 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMOQ99835 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMOQ99835 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMOQ99835 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMOQ99835 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMOQ99835 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMOQ99835 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMOQ99835 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMOQ99835 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMOQ99835 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMOQ99835 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMOQ99835 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMOQ99835 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMOQ99835 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMOQ99835 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMOQ99835 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMOQ99835 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMOQ99835 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMOQ99835 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMOQ99835 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms