Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms