Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms