Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCD7Q8N8D1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD7Q8N8D1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms