Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C17orf53Q8N3J3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms