Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms