Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms