Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lancl3Q8CD19 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms