Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
6820408C15RikQ8BJX2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms