Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms