Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRRC9Q6ZRR7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms