Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms