Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms