Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac4Q6NZM9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms