Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr44Q6NVE8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms