Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt12Q64291 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt12Q64291 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms