Protein–RNA interactions for Protein: Q61315

Apc, Adenomatous polyposis coli protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcQ61315 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApcQ61315 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApcQ61315 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApcQ61315 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms