Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cln3Q61124 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln3Q61124 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms